Prokarioti su evolucijski najstariji jednostanični organizmi. Naseljavaju cijelu biosferu. Imaju važnu ulogu u ekosustavu kao razlagači te je samo 1% svih prokariota patogeno. Sistematizirani su u dva carstva: eubakterije i arhebakterije. Nasljedni materijal prokariota je kružna DNA koja se nalazi u središnjem, nepravilno oblikovanom dijelu stanice – nukleoidu.